校旗是学校精神、学校风貌的形象标识。为确定具有鲜明山东体育学院特色的校旗，院党委宣传部多方征集意见，借鉴兄弟院校的成功经验，并从学院实际出发设计多幅样稿，经院长办公会议审议，最终确定。

校旗设计说明：设计方案由蓝、白两色和校徽标志组成，蓝色为主基调，是校旗背景；白色为“山东体育学院”中文汉字和英文字母颜色；校徽位于左上角。校旗设计主题鲜明，色彩明快，图案简洁、凝练，富有象征意义。蓝色象征着大海，寓意胸怀像大海一样宽广，知识像大海一样渊博，体魄像大海一样刚健，创新像大海一样奔涌。白色在现代社会寓意纯洁、端庄、正直、少壮，在森罗万象中有高远的意境，象征着我院教职工纯洁无私的奉献精神以及拼搏进取的历史使命。加上校旗左上角学院校徽图案，表明今后我院正式有了自己的形象标识。